| Name | First Aired | Runtime | Image | |
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| S15E01 | 超秘密の通学路（前編） |
January 23, 2006
YTV (JP)
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| S15E02 | 超秘密の通学路（後編） |
January 30, 2006
YTV (JP)
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| S15E03 | もう戻れない二人（前編） |
February 6, 2006
YTV (JP)
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| S15E04 | もう戻れない二人（後編） |
February 13, 2006
YTV (JP)
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| S15E05 | 本庁の刑事恋物語7（前編） |
February 20, 2006
YTV (JP)
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| S15E06 | 本庁の刑事恋物語7（後編） |
February 27, 2006
YTV (JP)
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25 | |
| S15E07 | コナン変な子 |
March 6, 2006
YTV (JP)
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| S15E08 | 名犬クールのお手柄 |
April 10, 2006
YTV (JP)
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| S15E09 | 探偵団に注目取材（前編） |
April 17, 2006
YTV (JP)
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| S15E10 | 探偵団に注目取材（後編） |
April 24, 2006
YTV (JP)
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| S15E11 | 上戸彩と新一 4年前の約束 |
May 8, 2006
YTV (JP)
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| S15E12 | お魚メールの追跡 |
May 15, 2006
YTV (JP)
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| S15E13 | そして誰もいなくなればいい |
May 22, 2006
YTV (JP)
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| S15E14 | 極限のカースタント |
May 29, 2006
YTV (JP)
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| S15E15 | 最期のアーン |
June 5, 2006
YTV (JP)
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| S15E16 | 鉄骨に阻まれた男 |
June 12, 2006
YTV (JP)
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| S15E17 | ため息潮干狩り（前編） |
June 26, 2006
YTV (JP)
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| S15E18 | ため息潮干狩り（後編） |
July 3, 2006
YTV (JP)
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| S15E19 | ロシアンブルーの秘密 |
July 10, 2006
YTV (JP)
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| S15E20 | 封印された洋窓（前編） |
July 24, 2006
YTV (JP)
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| S15E21 | 封印された洋窓（後編） |
July 31, 2006
YTV (JP)
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25 | |
| S15E22 | 目黒の秋刀魚事件 |
August 14, 2006
YTV (JP)
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| S15E23 | 本庁の刑事恋物語 偽りのウエディング |
August 21, 2006
YTV (JP)
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| S15E24 | トリックVSマジック（前編） |
August 28, 2006
YTV (JP)
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| S15E25 | トリックVSマジック（後編） |
September 4, 2006
YTV (JP)
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| S15E26 | こんぴら座の怪人 |
September 11, 2006
YTV (JP)
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50 | |
| S15E27 | 因縁と友情の試写会 |
October 23, 2006
YTV (JP)
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| S15E28 | ひっくり返った結末（前編） |
October 30, 2006
YTV (JP)
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| S15E29 | ひっくり返った結末（後編） |
November 6, 2006
YTV (JP)
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| S15E30 | 俺が愛したミステリー |
November 13, 2006
YTV (JP)
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| S15E31 | 園子の赤いハンカチ（前編） |
November 20, 2006
YTV (JP)
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| S15E32 | 園子の赤いハンカチ（後編） |
November 27, 2006
YTV (JP)
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| S15E33 |
怪人ガチガチ規則男
season finale
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December 4, 2006
YTV (JP)
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| S15E34 | 1年B組大作戦! |
January 15, 2007
YTV (JP)
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| S15E35 | 消えた1ページ |
January 22, 2007
YTV (JP)
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| S15E36 | 黒の組織の影 幼い目撃者 |
January 29, 2007
YTV (JP)
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| S15E37 | 黒の組織の影 奇妙な照明 |
February 5, 2007
YTV (JP)
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| S15E38 | 黒の組織の影 謎の高額報酬 |
February 12, 2007
YTV (JP)
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| S15E39 |
黒の組織の影 真珠の流れ星
season finale
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February 19, 2007
YTV (JP)
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