Conan, Ran, Mouri, and Sonoko travel to Shikoku to see the kabuki play Phantom of the Konpira. It is a play based on Phantom of the Opera. Things start to mimic the play. There are requests for a heroine change, sightings of a phantom, and a deliberate attempt on the heroine, just like Phantom of the Opera. The chief of the stage setting is killed, and the chairman and the sponsor are arrested by circumstantial evidence. Conan uses Sonoko to reveal that heroine tried to ruin the theater's play.
Ran, Conan, Sonoko et Kogorô sont invités par Tamanosuke, un jeune directeur de théâtre rencontré il y a plusieurs mois dans une précédente enquête (Cf. 126-127), pour assister à la première de sa nouvelle pièce. Des tensions sont existantes. Sur le modèle de l’œuvre « le fantôme de l’opéra », l’actrice principale se fait attaquer par un fantôme qui sévit dans la ville depuis plusieurs mois.
Par chance, le fantôme est retrouvé. En effet, Tamanosuke est retrouvé de bon matin, couteau ensanglanté à la main, allongé aux côtés du cadavre de son technicien en chef. À moins, bien sûr, qu’il s’agisse d’un coup du fantôme du Konpira …
Ran, Conan, Kogoro e Sonoko vengono invitati da Tamanosuke ad una rappresentazione teatrale. Qui, i 4 scoprono che la protagonista dello spettacolo è stata minacciata ed è rimasta ferita a causa del crollo di parte della scenografia
Sonoko, Ran, Kogoro y Conan se dirigen a ver la última obra de Tamanosuke, ese director de teatro joven que aparece en un par de capítulos. La historia de la obra está estrechamente ligada a la del fantasma de la ópera, y siguiendo este arco argumental, empiezan a suceder cosas misteriosas: apariciones, voces, accidentes y una muerte. Después de una batalla contra lo sobrenatural, Conan alzará el telón del último acto, donde Sonoko será la encargada de ponerle voz a las deducciones del pequeño detective.