Season 2

12,000 years after the events in Genesis Aquarion, humans live on the star Vega under constant threat of trans-dimensional beings called Abductors. These enemies originate from Vega’s sister star Altair and raid Vega for human life. As a countermeasure, an organization known as Neo-DEAVA formed to combat the Abductors. They pilot advanced mecha suits called Aquaria and are strictly separated by gender. Boys and girls are not allowed contact; they are even restrained from fighting on the same battlefield. However, events take a shocking turn when an advanced Abductor mecha suit joins the fray. Two teenagers, Mikono and Amata, are dragged into the conflict. Unknowingly, Amata performs a taboo when he summons an Aquaria and initializes what is called the Forbidden Union between male and female Aquaria.

Douze mille ans après les événements de la Genesis of Aquarion, l'humanité sur la planète Vega est menacée par un nouvel ennemi de la planète Altair dont la population féminine a été anéantie par une mystérieuse maladie. Les Alteans en utilisant leurs "ravisseurs", envahissent les villes de Vega et kidnappent ses habitants à la recherche des femmes assez fortes pour survivre à la course inter-dimensionnelle du retour d'Altair Pour se défendre contre l'invasion, le Neo-DEAVA organisation établit deux équipes, l'une composée d'hommes seulement et l'autre de femmes, chacun pilotent leurs propres machines géantes appelées "Aquaria". Afin de protéger sa nouvelle amie Mikono, Amata Sora utilise son pouvoir dont il avait gardé dans le secret toute sa vie. Il va combiner les pilotes Vector avec son ami dans un seul robot, l'Aquarion géant légendaire va renaître une fois de plus.

アクエリオンのかつての激戦から1万2千年後―― 次元ゲートを超えた｢異次元｣からのアブダクターが人間を拉致し、その襲来に人々はおびえて暮らしていた。これに対抗できるのは｢アクエリア｣と呼ばれる合体兵器のみ。構成する3機のベクターマシンに乗り込むのは、学園｢ネオ・ディーバ｣に集められた若きエレメント候補生たちである。だが学園の男女間は恋愛できないよう障壁で隔てられ、男女間の合体もかたく禁止されていた。ある日、エレメント能力を隠して孤独に生きてきた少年アマタは、少女ミコノと運命の出逢いをはたす。危機を目前にして彼女を抱いたままベクターマシンに乗りこんだアマタは、無意識に叫んだ!――永らく禁じられた、その言葉を・・・。その真の姿が明らかになったとき、敵味方のすべてが変わり始める。恋愛禁止、男女合体禁止の状況で、《終わりを抱いた神話》が、いまここに起動する!