Season 2

Having narrowly avoided the collision with the asteroid, the Sidonia sets a course for the Lem system in order to wipe out the Gauna nest.

TVアニメの新シリーズ。外宇宙生命体・奇居子（ガウナ）により太陽系が破壊されてから1000年後の世界。宇宙を放浪する播種船・シドニアの最下層部で育てられた少年・谷風長道は人型巨大装甲・衛人の操縦士訓練生となる。仮象訓練で培った類まれなる能力により、シドニアを襲う数々の危機を救ったことで訓練生から正規操縦士になった長道だったが、戦友の星白閑を失ってしまう。そして奇居子の猛攻に苦戦を強いられつつも小惑星激突の危機を乗り切ったシドニアは、奇居子の巣を駆逐するためにレム恒星系へと進路をとるのだが…。

Пришельцы Гауна — страшная угроза, нависшая над человечеством. Спасаясь от преследования ужасных врагов, люди отправились в космос на корабле «Сидония» в поисках нового дома. Рыцари-пилоты защищают корабль, но Нагатэ Таникадзэ, один из лучших пилотов, понимает, что пришельцы постепенно одерживают верх. Товарищи гибнут, а новое оружие быстро получает отпор. Если ничего не предпринять, враг победит. В отчаянной ситуации требуются отчаянные действия. Военные и учёные создают химеру на основе забытых знаний. Имя ей — Цумуги Сирауи. Существо с телом Гауна и личностью человека теперь помогает в битвах, но не все одобряют это решение. Так или иначе, на пути к новому дому землян стоит ещё много препятствий.