Season 1

After destroying Earth many years ago, the alien race Gauna has been pursuing the remnants of humanity—which, having narrowly escaped, fled across the galaxy in a number of giant seed ships. In the year 3394, Nagate Tanikaze surfaces from his lifelong seclusion deep beneath the seed ship Sidonia in search of food on the upper levels, only to find himself dragged into events unfolding without his knowledge.

Тысячу лет назад неизвестная раса Гауна уничтожила Солнечную систему. Эти гигантские, практически неуязвимые существа не обладали разумом. Выжившие земляне покинули Солнечную систему на космических кораблях «Сидония», благодаря чему человеческий род был спасён. В своих странствиях по космосу, спасаясь от преследования инопланетных существ, люди научились создавать пилотируемые механизмы для собственной защиты. Вся жизнь Нагатэ Таникадзэ прошла в одиночестве на космическом корабле. После того как его обнаружили, стало ясно, что он обладает талантом управлять боевыми механизмами. Он начал учиться пилотированию и теперь вместе с коллегами-пилотами ведёт тяжёлую и опасную войну против Гауна, сражаясь за выживание человечества.