ラピスの街に住む見習い魔女メグ・ラズベリーは17歳の誕生日に、師である『永年の魔女』ファウストから余命1年の呪いを宣告される。助かる方法が不可能に近いことに不貞腐れていると、とある少女から母親が眠ったまま起きない話を聞く。
メグの親友の学生、フィーネが魔女の館へ相談に訪れる。彼女のお願いは、祖父の形見である古い腕時計を直すこと。動かなくなった腕時計は、時計に宿る精霊が弱っているようで――
ファウストが家を空け、留守番をするメグのもとに、東洋からきた七賢人の一人『英知の魔女』祈が訪れる。祈は会話を重ねていくうちに、メグの余命が短いことを見抜いてきて――
メグと同い年で七賢人の『祝福の魔女』ソフィが異界祭りのためラピスの街を訪れる。美しい魔法パフォーマンスで人々を喜ばせているソフィだが、彼女の目的は「魔法をこの世から消すこと」で――
メグとソフィは異界祭りの会場でマリーと出会う。彼女は昨年の祭りで一緒に花火を見た男性を探していた。今年は花火が上がらないと知り、再会を諦める彼女を見てメグは共に男性を探すことを決める。
嬉し涙を集めるコツをつかみ、効率良く50粒まで涙を集めほくそ笑むメグ。涙を集めることに夢中で大事な気持ちを見失っているメグの様子を見て、ファウストは彼女に「魔法禁止」を言い渡す。
