Der hochbegabte Grundschüler Ken ist von seiner ihn bewundernden Umgebung angewidert und verlässt die Menschenwelt, um ein noch mächtigerer DigiKaiser zu werden. Seine Eltern brechen sein Zimmer auf und finden seinen Abschiedsbrief. In der DigiWelt erobert Ken in der Zwischenzeit immer mehr Gebiete. Die DigiRitter gehen ebenfalls in die DigiWelt und sehen, wie SkullGreymon dort wütet. DigiKaiser hatte Agumon in seine Gewalt gebracht und ihn eine schwarze Digitation machen lassen, die es zu SkullGreymon werden ließ.
Ken leaves the real world because his identity has been revealed, but when he targets Agumon for control, can the digi-destined find some way to free their friend?
デジモンカイザーの正体は天才少年、一乗寺賢だった。賢の自宅に向かうが、すでに現実世界に別れを告げて、消えていた…。その頃カイザーは、征服のための武力として太一のアグモンに狙いをつける。だがイービルリングの暴走により、アグモンはスカルグレイモンへと進化!
Ken se encuentra deprimido por lo que es su vida en la tierra, por lo que sus padres se preocupan mucho por el, en ese momento sus padres entran a su habitación y ven un mensaje diciendo de que no puede vivir más en ese mundo. Por otro lado Davis le cuenta a los demás la verdad del emperador y deciden ir su casa a verlo, cuando ven a la policía que lo está buscando, es por ello que los niños deciden ir a buscarlo al Digimundo al llegar se encuentran con cinco Meramon que se encontraban poseídos por los anillos negros por lo que Flamedramon, Halsemon, Digmon, Pegasusmon y Nefertimon deciden enfrentarlos.
Ken fuit de chez lui, préférant retourner dans le digimonde. Il capture Agumon, et le force à se digivolver au niveau Ultime, ce qui provoque l'apparition de l'incontrôlable SkullGreymon. SkullGreymon à bout de souffle se dé-digivolve en Agumon, mais l’Empereur arrive quand même à mettre son plan à exécution.