Ryoko's data is repaired thanks to Sin's data transplant, but her emotional data component is locked within the Altair so she is seemingly emotionless in the server. She and Kyo explore the real world, where he affirms that while he and Ryoko are only apparitions, they will some day be able to touch the real world.
“復元者”シンの一部を移植されたリョーコの幻体データーを分析し、彼女がほぼ完全な状態にまで修復されている事を確認するシマたち。リョーコは昏睡から目覚め、普通に日常生活を送れるようになったが、感情を形成する領域がゼーガペイン・アルティールに取り残されたため、アルティールにエンタングルした時を除いては感情欠損状態だった。そのリョーコを独りにしておけなくて、何かと気にかけるキョウ。オケアノスでは、シマがシズノに最終作戦の決行が近い事を告げる。そんなシマ&シズノの不可解な行動に不信感を募らせるルーシェンやクリスたち。一方、世界の仕組みを知らぬまま、毎日を懸命に生きているカワグチたちに複雑な思いのキョウは、ついつい彼らに反発し、その態度が原因で殴り合いの喧嘩になってしまう。
Шима и остальные анализируют данные幻体 Рёко, в которую была пересажена часть "восстановителя" Сина, и подтверждают, что она почти полностью восстановлена. Рёко приходит в сознание и может вести обычную жизнь, но из-за того, что область формирования эмоций осталась в Зэгапэйн Артиле, она испытывает эмоциональную недостаточность, кроме случаев, когда она связана с Артилем. Кё, не желая оставлять Рёко одну, постоянно о ней заботится. Тем временем, в Океаносе Шима сообщает Шизуно о приближении финальной операции. Не понимая странных действий Шимы и Шизуно, Рушен и Крис начинают испытывать недоверие. С другой стороны, Кё, который живет каждый день, не зная о механизмах мира, испытывает сложные чувства к Кавагучи и в итоге, из-за своего отношения, оказывается вовлечён в драку.