Die gefangen genommenen Infizierten scheitern an einem Ausbruchsversuch. Als sie in eine Hochsicherheitseinrichtung überführt werden sollen, greift Captain Manning den Transport an. Obwohl Cavennaugh die Flucht der Häftlinge verhindern kann, entwischt ihm Manning, der Agent Hayes entführt. Was viele nicht wissen: Hayes ist Cavennaughs Bruder. Lucas wird in der Zwischenzeit vom Dienst befreit, da er Symptome der Beeinflussung durch das Signal zeigt. Fenway soll ihn untersuchen.
Molly and Baylock realize the Threshold detainees must be moved immediately to a more secure facility in West Virginia when a prisoner attacks and infects a security guard, then tries to break himself and other infected prisoners out of their cells.
Après une tentative d'évasion au centre Threshold, l'équipe organise le transfert des contaminés dans un lieu de détention mieux sécurisé. Un agent de sécurité, infecté par le virus, passe un pacte avec Molly : il l'aidera à décrire l'évolution de sa contamination à condition qu'elle le tue lorsqu'il sera devenu comme les autres personnes infectées...
A Küszöb parancsnokságról megszöknek a fertőzöttek, de szerencsére sikerül őket hatástalanítani. Molly éppen ezért úgy dönt, hogy ideje a rabokat elszállítani. Kiderül, hogy Adams őrnagynak, aki vigyázott rájuk, hallucinációi voltak és emiatt sikerült a fogva tartottaknak megszökniük, s így már szinte biztos, hogy Adams megfertőződött. Molly-ra később rátámadnak a saját lakásában, mialatt Cavennaugh-ékat is támadás éri.
Tre prigionieri infettati e rinchiusi nel quartier generale del progetto Threshold tentano la fuga. Durante l'evasione, uno dei soldati viene contagiato dal virus alieno. Mentre Fenway tenta di scoprire in che modo il sergente Adams è entrato in contatto con la mutazione, Baylock e Caffrey organizzano il trasferimento dei prigionieri in un sito più sicuro. Nel corso dell'organizzazione del piano, i due entrano in conflitto con il nuovo Consigliere per la Sicurezza Nazionale. Lucas mette a punto un nuovo tipo di manette. Adams racconta a Caffrey di aver sperimentato dei ricordi che non gli appartengono. Inoltre si fa promettere dalla dottoressa di essere eliminato in caso il virus dovesse prendere il sopravvento. Caffrey è costretta ad eliminare un uomo che era entrato in casa sua per riferirle un messaggio. Il convoglio con i prigionieri viene assaltato da un gruppo di mercenari agli ordini di Manning, uno dei sopravvissuti della Big Horn. Nel corso dell'attacco, il fratello di Cavennaugh viene fatto prigioniero. Quando Lucas fa il nome di un nuovo collega che lo ha aiutato nella messa a punto delle manette, Baylock e Ramsey si rendono conto che il giovane è caduto preda di un'allucinazione. Grazie all'autopsia eseguita sul cadavere di Adams, Fenway scopre che il contagio è iniziato nell'apparato digerente: gli alieni hanno quindi infettato il cibo.
Molly y Baylock advierten que los detenidos en Threshold deben de se trasladados de inmediato a una instalación más segura en West Virginia. Uno de los prisioneros infecta a un guardia de seguridad e intenta escapar ayudando al resto de presos abriendo sus celdas.
