Agentin Alex Munro übernimmt die Leitung der Agentur und setzt das Team sofort auf einen neuen Fall an: Aus Krankenhäusern sind zahlreiche Babys verschwunden. Die Spuren führen Darien zu Befruchtungskliniken, die alle derselben Gesellschaft gehören. Offenbar steckt wieder einmal Chrysalis dahinter. Die entführten Kinder werden alle in einem Camp einer gefährlichen Gehirnwäschen unterzogen.
The Agency is now controlled by the Department of Human Services. Quintuple-A rated agent Alex Munro comes barging in, taking control of the place. She knows everything about everyone, but her own record is murky. Her first case is to have the Agency investigate the disappearance of babies from hospitals. Fertility clinics owned by the same corporation are the key factor. The team prevents an abduction and tracks the abductor to a summer camp where children are being raised from birth and brainwashed by the Chrysalis organization. A standoff between the Agency and the armed children ensue, but Darien breaks the stalemate by entering the compound and calling for Chrysalis leader Stark. Darien convinces Stark to release the children rather then have them get killed. The children turn themselves in, but Stark escapes as part of the deal. It turns out that Alex's baby was one of the abductees...and her child isn't among the residents of the camp.
Avec l'aide d'un nouvel agent Alex Monroe, Darien et Hobbes mènent une enquête sur de mystérieuses disparitions de bébés. Ils réalisent que toutes les mères avaient été inséminées dans des cliniques appartenant à la même société. Cette découverte les mène à un camp d'endoctrinement, dans lequel la sinistre Agence Chrysalis crée sa propre armée de soldats dont la formation commence dès la fécondation...
В недавнем прошлом организация «Кризалис» начинает программу искусственного оплодотворения в сети своих клиник. Родившихся затем детей они похищают и увозят, искусно заметая следы, чтобы никто из тех детей не был найден. Тем временем в Агентстве снова начинаются перемены — Эбертс меняет знак Департамента по делам индейцев на Департамент здравоохранения. Дэриэн и Хоббс приходят к Чиновнику и хотят знать, не вылетят ли они с работы, и почему они снова поменяли департамент. В это время в офис входит женщина и представляется новым агентом — Александрой Монро. Чиновник отвечает, что у него нет средств на нового агента, и тогда Алекс отдает ему свою папку с делом, которое подписано какой-то важной шишкой. Чиновник не уступает, и Алекс рассказывает все, что знает о Хоббсе и Дэриэне, включая то, что он — невидимка, а Хоббс — параноик. Также она упоминает, что Эбертс занимается здесь компьютерами и бухгалтерией, а Чиновнику вечно нужны деньги на покрытие дыр в бюджете. У нее же открытый счет, и Чиновник берет ее на работу. Алекс идет наверх в свой новый кабинет, а Дэриэн и Бобби остаются с