Jetzt, da Cephiro seine Säule, Prinzessin Emeraude, verloren hat, wird es von drei Ländern angegriffen: Autozam, Chizeta und Fahren! Clef will nicht, dass sich die Mädchen in diesen neuen Krieg einmischen, aber Hikaru, Umi und Fuu stimmen dem von selbst zu.
Now that Cephiro has lost its Pillar, Princess Emeraude, it is under attack from three countries – Autozam, Chizeta, and Fahren! Clef doesn't want the girls to get involved in this new war, but Hikaru Umi, and Fuu agree to it on their own.
Les Magic Knights sont de retour sur Cephiro. Elles retrouvent le mage Clef qui leur explique les conséquences de la disparition du Pilier de Cephiro...
I regni intenzionati ad invadere Cefiro sono Autozam, una civiltà tecnologica in cerca di nuove fonti energetiche, Chizeta, un mondo piccolissimo e sovrappopolato che vuole espandere i propri territori, e Fahren, che sta avanzando per ragioni ignote. Clef spiega che l'obiettivo degli invasori è divenire la nuova Colonna Portante e le ragazze decidono di tornare ad essere i Cavalieri Magici per proteggere Cefiro: Clef restituisce alle ragazze le loro armature e i loro poteri, Presea (misteriosamente sopravvissuta all'attacco di Ascot nella prima stagione) le equipaggia con le loro spade e i Geni Managuerrieri si risvegliano per combattere assieme a loro. Il primo nemico da affrontare è Aquila, comandante dell'armata di Autozam, che combatte a bordo del suo potentissimo robot FTO.
타국으로부터 세 나라가 세피로로 진군한다는 이야기를 크레프로부터 듣게 된 소녀들은 갑옷과 무기를 받고 다시 한 번 세피로를 위해 싸우겠다고 다짐한다.
Ahora que Cephiro ha perdido su pilar, la princesa Esmeralda, está siendo atacada por tres países: ¡Autozam, Cizeta y Fahren! Clef no quiere que las chicas se involucren en esta nueva guerra, pero Lucy Marina y Anaís lo aceptan por su cuenta.
