Siobhan Beckett bringt den Jungen zur Welt, den Ha'gel, der letzte Vertreter einer außerirdischen Rasse, die von den Taelons vernichtet wurde, im Körper von Agent Sandoval mit ihr gezeugt hat. Kein gewöhnliches Kind: Innerhalb weniger Stunden entwickelt es sich zu einem erwachsenen Mann. Nachdem die Ärztin Melissa Park alle Erinnerungen der Mutter an das Geschehene löscht, wird Siobhan Beckett vom Widerstand wieder freigelassen. Kurze Zeit später tritt Captain Liam Kincaid die Nachfolge von William Boone an, der immer noch mit dem Tod ringt. Wie Boone arbeitet auch der mysteriöse Kincaid gleichzeitig für die Taelons und den Widerstand.
Unterdessen bahnt sich eine weltweite Katastrophe an: Die Jaridianer, eine feindliche Rasse Außerirdischer, sind auf dem Weg zur Erde. Der Widerstand muß sich dieser Bedrohung ohne William Boone stellen: Er ist seinen schweren Verletzungen erlegen, und Lili weiß, daß dafür Zo'or verantwortlich ist. Die Jaridianer haben die ehemalige Widerstands-Wissenschaftlerin Rayna in einen Replikanten verwandelt, der während Boones Beerdigung Quo'on tötet. Liam Kincaid kann Da'an vor dem nächsten Angriff retten und wird sein persönlicher Leibwächter. Die Taelons versuchen, den Jaridianern eine Falle zu stellen, aber Zo'or und Sandoval sabotieren heimlich diesen Plan. Als der Replikant in Da'ans Unterkunft eindringt, muß Kincaid feststellen, daß die Waffe, die Sandoval ihm gegeben hat, defekt und der Fluchtweg blockiert ist. Aber mittels seines Shaqarava, einer alten Kraft, die primitive Taelons beherrschten, kann er den Replikanten ausschalten. Da'an weiß, daß Liam zum Teil ein Alien ist, schweigt aber. Er braucht jeden Verbündeten: Die Synode hat nach Quo'ons Tod seinen Erzfeind Zo'or als Anführer ausgewählt.
Nine hours after Beckett conceived, her child is born. The Resistance must decide what to do with Beckett and her rapidly developing child, Liam Kincaid, who reaches maturity within minutes of being born. Sandoval reveals Boone's ultimate fate to Lili. Rayna transmits a signal to the Jaridians, an alien race. A Jaridian probe replicant assassin is set to destroy all Companions. At Boone's funeral the Taelon Synod leader, Quo'on, is assassinated, but Liam saves Da'an. Da'an appoints Liam as his personal protector. Zo'or realizes that if the replicant kills Da'an, then he'll be made synod leader by default.
Becket a accouché de Liam, qui grandit et atteint sa taille adulte en quelques heures seulement. William Boone a trouvé une fin tragique, et Liam assiste à ses funérailles. Il sauve Da'an de l'attaque d'une sonde et devient son protecteur...