京都の港町で、浦島太郎になぞらえた怪事件を追うコナン、蘭、小五郎。しかし、事件の糸口がつかめないまま夜を迎える。その時、再び浦島太郎のメロディが鳴り響き、容疑者の一人・富樫瞳の遺体が港に浮かぶ。止められなかった事件の連鎖。悔しさをにじませるコナンたちの前に、京都府警の警備艇が現れる――。その先端に立つのは、シマリスを連れた綾小路文麿警部！ 水面のように揺れる真実、その先で待つ決死の攻防とは！？
Conan, Ran et Kogoro poursuivent une affaire mystérieuse dans une ville portuaire de Kyoto, qu'ils comparent à Urashima Taro. Cependant, la nuit tombe sans qu'aucun indice n'ait été trouvé. C'est alors que la mélodie d'Urashima Taro retentit à nouveau et que le corps d'un des suspects, Hitomi Togashi, flotte dans le port. Un enchaînement d'événements qu'il était impossible d'arrêter. Un bateau de la police préfectorale de Kyoto apparaît devant Conan et ses amis, frustrés. Au bout du bateau se tient l'inspecteur Ayakoji Fumimaro avec son tamia ! La vérité tremble comme la surface de l'eau, et une défense désespérée les attend !
