After their first encounter with the new evil, Yugi and the others are concerned to learn from Professer Hawkins that their appearance could have some connection to the destruction of the ancient civilisation, Atlantis. With so many thoughts running through his mind, Yugi's sleep is restless as he is drawn to a world of Duel Monsters where he is told of the three Legendary Dragons and unseals the first of them, Timaeus.
Le monde est au bord de l'apocalypse tout comme le monde des Monstres de Duel. Les gardiens de la Terre et du monde des monstres doivent s'unir pour affronter le Grand Léviathan qui sème le chaos.
Il drago senza nome - Timaeus
Die große Bestie erwacht aus ihrem tiefen Schlaf und ernährt sich sowohl von Menschen als auch von Monstern, um sich zu stärken. Das Schwarze Magiermädchen ruft Yugi zu Hilfe. Yugi und Yami-Yugi befreien einen der drei kristallisierten Drachen, Timaeus, und halten mit ihm die große Bestie vorerst auf. Aber der Kampf geht weiter.
El profesor Hawkins revela que los Monstruos de Duelo se originaron en la perdida Atlántida, muchos años antes que en el antiguo Egipto. Los tres motociclistas, llamados Rafael, Valon y Alister, le entregan los tres Dioses Egipcios a su amo, Dartz, quien ofrece el poder de los tres dioses a la bestia Leviatám. Por otra parte, "Chica Maga Oscura" se comunica con Yugi y el faraón para revelarles todo acerca de la bestia y la forma de detenerla. Para ello, Yugi libera a uno de los tres Dragones Legendarios, llamado "El Ojo de Timaeus", con el cual logra detener temporalmente a la bestia.
ドーマの三銃士は、「神のカードを返してほしくば我々を倒せ」と言い残して消えた。心の迷宮の中から「助けて」という声を感じた遊戯。声の主は、デュエルモンスターズ世界にいるブラックマジシャンガールだった。
بعد لقاءهم الأول مع الشر الجديد، يهتم يوغي والآخرون بالتعلم من الأستاذ هوكينز أن ظهورهم قد يكون له علاقة بتدمير الحضارة القديمة، أتلانتس.