ある日、寝ていたケータの腕から光を放ち突然妖怪ウォッチが消えてしまった。さくらニュータウンに現れた超巨大猫妖怪デカニャンに友達を助けて欲しいと頼まれ、手がかりを探しに祖母の家のあるケマモト村に向かう。そこで、妖怪ウォッチが消えた謎の鍵を握る妖怪フユニャンと出会う。妖怪ウォッチを取り戻すため、ケータはウィスパー、ジバニャン、フユニャンと共に、60年前の世界にタイムスリップする。しかしそこには、強大な敵が待ち受けていた。
Однажды, когда Кэта спал, из его руки вдруг вырвался свет, и ёкай уотч исчез. Огромный кот-ёкай Дэканьян, появившийся в Сакура Ньютон, попросил его помочь спасти друзей, и Кэта отправляется в деревню КэмаМото, чтобы найти подсказки. Там он встречает ёкая Фюнян, который держит ключ к загадке исчезновения ёкай уотч. Чтобы вернуть ёкай уотч, Кэта вместе с Уиспом, Джибаньяном и Фюняном отправляется в прошлое, в мир 60-летней давности. Но там их уже поджидает могущественный враг.
Nathan trouve l'aide du Yo-kai Hovernyan et utilise une pierre à retardement pour emmener Nathan, Whisper et Jibanyan dans le temps, 60 ans après l'invention de la montre Yo-kai par le propre grand-père de Nathan: Nathaniel alors qu'il était enfant. Lady Perpétua en prend bonne note et essaie d'éloigner le monde humain du monde Yo-kai. Ensemble, les deux garçons combattent Lady Perpétua et ses méchants méchants Yo-kai Perfides pour sauver le monde de ses plans diaboliques.
