Die Rückkehrer aus der Zukunft stehen vor neuen Herausforderungen: Richard und Lily beobachten geschockt, wie ihr Kind Isabelle plötzlich um zwanzig Jahre altert und erwachsen wird. Und auch Lily macht einen dramatischen Alterungsprozess durch. Tom und Diana entdecken unterdessen eine radikale Organisation unter den Rückkehrern. Offenbar hat die so genannte Nova-Gruppe Verbindungen zu Shawn und dem 4400-Zentrum.
Ryland and other government officials are on trial for withholding vital information that they discovered about the returnees when a disturbing sound is heard the courtroom. Tom and Diana, with the help of Gary Navarro, try and track down T.J Kim, who they believe is responsible for the piercing sound heard in the courtroom. Richard and Lily are forced to deal with a now grown Isabelle While Lily also suffers from a rapid aging disease that Shawn is unable to heal. Tom and Diana also investigate a radical organisation called the Nova Group that appears to have ties with Shawn and the 4400 Center.
En pleine cour de justice Ryland s'explique sur le scandale de l'inhibiteur et plébiscite des mesures radicales pour contrôler les 4400. Celui-ci se fait violemment agresser. La méthode sonore rappelle le précédent incident au NTAC. Grâce à l'aide de Gary Navarro, Diana et Tom se lancent à la poursuite de TJ Kim et se heurtent aux frappes radicales du groupe Nova, tous des 4400. Au centre, Shawn et Richard découvrent un matin qu'Isabelle n'est plus un bébé mais une jeune femme...
Isabelle-ből percek alatt gyönyörű, húszéves, fiatal lány lett. Richardnak nem csak ezzel a ténnyel kell szembesülnie, hanem azzal is, hogy mindeközben felesége Lily, hetvenöt éves asszonnyá változott, és egészségi állapota ezzel rohamosan gyengülni kezd.
Ryland viene interrogato riguardo il programma di inibizione della promicina e sul perchè non avesse chiesto l’approvazione dei suoi capi. Durante l’interrogatorio viene emesso un suono fastidioso come il fischio di un microfono. Prima di rispondere ad un’altra domanda Ryland chiede consiglio al suo avvocato, ma questi inizia a dargli contro. Più tardi Diana e Tom insieme a Gary Navarro cercano di rintracciare TJ Kim, che ritengono responsabile dell’episodio accaduto durante il processo. Shawn si incontra con Daniel Armand, uno dei 4400 scomparso nel 1990, che ha bisogno che Shawn curi un suo amico. Lily soffre di un rapido invecchiamento e i poteri di Shawn non sono in grado di curarla. Tom e Diana scoprono l’esistenza di un gruppo terrorista chiamato Nova Group che sembra avere dei legami con Shawn.
Gary Navarro viene arrestato per aver tentato di assassinare una seconda volta Ryland. Isabelle, credendo di salvare la vita a sua madre uccidendosi, si getta dal tetto del centro 4400, ma si rialza senza un graffio. Matthew Ross esprime il suo disappunto nei confronti di Isabelle per ciò che ha tentato di fare le parla dell’importanza della sua esistenza per il futuro dell’umanità. Isabelle, è preoccupata per ciò che le ha detto Matthew, ma dopo aver parlato con Shawn decide di essere lei l’artefice delle sue scelte e non il destino. Matthew dà ad Isabelle una sostanza che iniettata è in grado di ucciderla.
Во время процесса по делу Денниса Райланда и его сообщников одна из вернувшихся, Ти Джей Ким, используя способность тяжело ранит его. Образуется группа «Нова», собранная из вернувшихся, которая начинает методично уничтожать всех, кто был замешан в деле об ингибиторе промицина. Том и Диана привлекают к делу одного из 4400 — Гэри Наваро, умеющего читать мысли. Гэри пускает их по ложному следу, сотрудничая с группой «Нова». Вскоре его обман раскрывается. Группа «Нова» на весь мир объявляет о том, что через пять дней начнётся новая эра — эра вернувшихся. Шон, обманутый группой «Нова», сдаёт их, Том и Диана арестуют Ти Джей Ким. В назначенный день группа «Нова» за одну ночь выращивает огромные гектары пшеницы на месте пустыни, утверждая тем самым, что они могут быть и миролюбивыми.
Ryland y su equipo del Gobierno son enjuiciados para conocer cómo y para qué utilizaron la información secreta de los abducidos. Durante el juicio, todos presenciarán un extraño suceso que cambiará las expectativas del proceso.