Ensimmäinen tuotantokausi tiivistettynä yhdeksi tarinaksi.
Vi ser hvordan den japanske ninja-kriger Hamato Yoshi bliver til kriger-rotten Splinter, som leder banden af grønne menneske-lignende Ninja Turtles. Donatello, Raphael, Michaelangelo og Leonardo slås for det gode og bekæmper det onde i storbyen. Vi møder April og den mægtige onde Shredder, der vil standse vores grønne helte for at kunne bestemme over hele verdenen. Kan Turtlerne afbryde deres pizzaspisning længe nok, til at stoppe Shredder, inden det er for sent - eller vil det onde vinde kampen om herredømmet?
