A failed mutagen experiment results in an invasion of giant insects and arachnids in New York City.
Krang está trabajando en duplicar el mutágeno original cuando Bebop y Rocksteady entran y lo arruinan. Una mosca aterriza en el mutágeno y aumenta de tamaño. Al no poder controlarlo, Bebop y Rocksteady envían el insecto gigante a la Tierra. Después de ver lo que el mutágeno le hace a la mosca, Krang y Shredder deciden usarlo para crear grandes insectos para dominar el mundo. Genghis Frog (un amigo de las tortugas) decide ir a la ciudad y ver a sus amigos. Al llegar allí, ve la enorme mosca y comienza a perseguirla. Mientras tanto, las tortugas miran televisión y ven el informe de abril sobre la mosca masiva. Los TMNT van a comprobarlo y terminan rescatando a Genghis del gran error. En Dimension X, Krang y Shredder usan el mutágeno en tres errores y los envían a la Tierra para mantener ocupadas a las tortugas mientras avanzan en su plan. Su esquema es encontrar un hormiguero y usar el mutágeno en las hormigas.