Michaelangelo must rescue the other Turtles when they are captured by an evil scientist.
Las tortugas van junto con Michaelangelo y su paloma mascota Pete al zoológico para que el Dr. Goodfellow pueda observar al pájaro. Después del examen, Michaelangelo se va solo mientras las otras tortugas se dirigen a casa. Justo cuando están a punto de irse, Donatello, Leonardo y Raphael son atrapados por robots creados por el Dr. Lesseau. Los robots llevan el TMNT a una isla cerca del zoológico donde el Dr. Lesseau espera su llegada. El Dr. Lesseau es un científico que usa sus robots para robar animales del zoológico. Él está experimentando con ellos para crear un solo animal con los mejores rasgos de todos los animales combinados. El loco Doc quiere las tortugas por sus cerebros. Michaelangelo regresa a la guarida y encuentra a los otros desaparecidos. Splinter le dice que había tenido una visión de una isla mientras meditaba y cree que las otras tortugas están en peligro.