When Michaelangelo decides to put one of Donatello's inventions on max power for his own entertainment, he ends in a--quite literally--little problem. April and Vernon get caught in the shrinking ray while getting footage of a military ship and join Michaelangelo on his wild adventure.
Mientras Michaelangelo está probando una tabla de vela en las alcantarillas, accidentalmente es arrastrado al puerto de la ciudad. Al mismo tiempo, un capitán llamado Talbot Breech está probando su rayo miniaturizante en un barco. Su plan es reducir todos los barcos navales y ponerlos en botellas para su colección para vengarse de aquellos que lo rechazaron por la Academia Naval. La pistola de rayos encoge accidentalmente a Miguel Ángel y él termina en una botella junto con los otros barcos en el laboratorio del capitán. El gato de Breech, Claude, golpea a Michaelangelo del estante, rompe la botella y lo libera. No se da cuenta de lo pequeño que es realmente hasta que se encuentra cara a cara con Claude. Michaelangelo logra burlar a Calude y huir de una enorme rata. Mientras tanto, en el puerto, April y Vernon están cubriendo una historia sobre uno de los portaaviones de la Armada.