The Dark Turtles are tired of losing and being abused by Darius Dun. With Dun’s orders to destroy the Turtles looming, Dark Leo comes up with a plan to destroy his opponents from within!
As obscuras Tartarugas Ninja têm uma missão: destruir as verdadeiras Tartarugas Ninja.
Darius er sur på de sorte Turtles, og placere ansvaret på den sorte Leonardos spinkle skuldre. For at bevise at han er lederen af de sorte Turtles, vil han ødelægge de rigtige Turtles indefra. Mens han prøver at udføre hans plan, gør hans tid med Turtles ham til en anden person, og det spolere hans plan.