Auf der Suche nach Splinter verfolgen die Turtles einen Wächter, der mit dem Verschwinden von ihrem Meister zu tun hat. Die Schildkröten verlieren jedoch die Spur vor dem Gebäude der Firma TCRI. Donatello erinnert sich, dass das Geschäft auch als Aufschrift auf den Fässern mit dem grünen Schleim stand, der die Turtles einst mutieren ließ. Die Turtles steigen durch eine Abgasleitungsabdeckung ein. Michelangelo und Donatello verlieren jedoch den Halt und stürzen in die Tiefe.
As the Turtles continue their search for Splinter, they turn their attention to the Guardians. The trail soon leads them to a building marked as "TCRI" - the same letters on the canister of ooze responsible for their mutation! Now with two reasons to infiltrate that building, the Turtles recruit both April and Casey to help get them inside.
В поисках своего учителя, Черепашки обращаются за помощью к Стражам, но те неожиданно отказываются им помогать. Проследив за одним из них, Четвёрка выходит на некий "Космический Научно-Исследовательский Институт" ("TCRI"). Судя по всему, в стенах именно этого здания скрыты ответы на многие их вопросы…