Emeraldas enquête sur une vague de destruction qui semble suivre la trajet du Galaxy Express 999, à destination de Râmetal. Léopard ignore les avertissement d'Albator et Maetel, et cette dernière décide de monter à bord du train spatial pour porter secours à sa soeur...
プロメシュームの気配を感じて宇宙を行くエメラルダスが、停止した999号を発見する。呼びかけに一切反応しない999号に彼女が乗り込むと、窓のシャッターが一斉に閉まった。次の瞬間、爆走を始める999号。捕らわれたエメラルダスを追って、メーテル、ハーロック、トチローを乗せたデスシャドウ号が急ぐ。
