Sonic und Tails wollen versuchen auf Eggmans Schiff zu gelangen. Chris will Big helfen, Froggy zu suchen.Eggman hat nun endlich seine neue Generation Roboter fertig gestellt. Sie sollen runter auf die Erde und Froggy suchen. Chris und Big können heimlich mit auf das Schiff gelangen. Während die anderen Roboter verschrottet werden sollen, soll E-102 Amy und den Vogel herbringen. Als er dann niedergeschlagen bei Amy ankommt, verwickelt sie ihn auch noch in ein Gespräch. Seine Gedanken kreisen um seine Kameraden und um das kleine Mädchen mit dem Vogel. Dann lässt er Amy frei.
After Amy's kidnapping, Sonic & Tails head off in the X Tornado to rescue her. Meanwhile, Knuckles gains most of the Master Emerald pieces and gets another vision of the past. After the vision, Knuckles puts the pieces on the altar and discovers the remaining pieces are in the Egg Carrier. Big & Chris manages to find Froggy, but gets stolen by E-102 Gamma and They sneak into the Egg Carrier. After Gamma's success of getting Froggy, Eggman sends the other E-series into other places and orders Gamma to get the bird that's with Amy. When Gamma confronts Amy, she persuades him to help her escape. Knuckles hitches a ride with Sonic & Tails and battles the Egg Carrier. After getting through the weapons, they enter the Egg Carrier where dangers await them.
Knuckles promette di continuare a cercare i frammenti dello Smeraldo Gigante, quindi si unisce a Sonic e Tails in una missione per salvare Amy dall'Egg Carrier.
Sonic y Tails parten en busca de Amy, mientras que en el Egg Carrier Amy sigue prisionera junto a Lilly y Eggman le ordena a los robots serie E capturar a Froggy, por lo que los robots parten a la misión.
