Nachdem Dr. Eggman ihm eine Falle gestellt hat, ist Chris der Gefangene des fiesen Forschers. Sonic versucht unterdessen alles, um seinen Freund zu befreien - doch er wird im Kampf schwer getroffen. Chris kann den Anblick seines besiegten Freundes nicht ertragen und mobilisiert noch einmal alle Kräfte, um sich selbst zu befreien ...
Chris, wanting to get Sonic and his friends back to their own world as soon as possible, ends up handing the Chaos Emeralds stored by Chuck over to Eggman. Having noticed that, Sonic and the others run after him in a hurry. However, Eggman ends up finding the last (white) Chaos Emerald. A tense battle ensues.
Eggman inganna Chris e Knuckles e si fa consegnare i loro sei Smeraldi, prendendo in ostaggio Chris. Per salvarli, Sonic affronta un robot alimentato a Smeraldi!
Los escarabajos del gobierno comienzan a atacar la nave de Eggman, pero Sonic trata de detenerlos, ya que Chris seguía dentro como rehén, aunque no quieren escucharlo ni logran derribar la nave enemiga, que sale ilesa y contraataca.
Sonic havner igen i en meget voldsom kamp mellem Dr. Eggman's robotter og hans bande. Han bliver selv hårdt såret, og det ser slet ikke så godt ud. Heller ikke hans venner Chris og Tails ved hvordan de skal hjælpe deres hurtige ven. Knuckels, den barske ræv redder ham i dette øjeblik, hvor Sonic forandres til Super Sonic. Dr. Eggman og hans robotter kan nu godt pakke sammen...