Nachdem Sonic X in eine andere Galaxie geschleudert wurde, landet er in einem Swimmingpool, aus dem ihn ein kleiner Junge namens Chris rettet. Chris ist es auch, der Sonic erklärt, dass er sich nun auf der Erde befindet. Gemeinsam mit seinem Opa will Chris alles tun, um Sonic zu helfen. Das bedeutet, dass sie zunächst Sonics Freunde Cream und Cheese aus der Militärbasis befreien müssen ...
While watching TV at Chris' house, Sonic learns that his friends Cream and Cheese are captured in a high security, top secret military research facility named Route 99. Chris speaks to his grandfather Chuck, and finds out the location of the facility. Sonic successfully sneaks in there, but the rescue operation immediately gets a lot more hectic and dangerous. It is then where Tails arrives at the scene and joins the group.
Avec l'aide de Chris, son nouvel ami, et du grand-père de ce dernier, Sonic va délivrer Cream et Cheese de la base militaire où on les retient prisonniers pour les étudier.
Con l'aiuto di Chuck, il nonno di Chris, Sonic deve salvare i suoi amici Cream e Cheese che sono tenuti prigionieri in una struttura militare.
Sonic se queda en la casa de Cris y después de ofrecerle comida para gato se marcha. La policía lo persigue creyendo que corriendo tan rápido por la ciudad es peligroso llegando a pensar que es un robot.