Nach den vielen Trainings gibt es endlich einen praktischen Auftrag für die fünf Shinobi-Azubis: Sie sollen einige halbstarke Raufbolde neutralisieren, die in einem Einkaufszentrum Ärger machen.
Asuka, Ikaruga, Katsuragi, Yagyu and Hibari are five school girls who secretly train in the ninja arts. As they are sent by their mentor, Kiriya, to handle some delinquents in town, Asuka meets a girl named Homura and helps guide her through town, unaware that she is secretly an enemy shinobi. Meanwhile, the others encounter the delinquents, who are soon revealed to be wooden puppets controlled by an enemy shinobi. As the girls manage to beat the puppets, Asuka remains blissfully unaware of Homura's true alliance.
国立半蔵学院―東京浅草にある名門マンモス進学校の知られざる裏の顔。
それは善忍と呼ばれる国家所属の忍を育成する秘密機関、通称忍学科の存在である—。
忍学科に所属する飛鳥たち5人の少女は学院の一般生徒に気付かれることなく、日夜一流の忍になるため、修行に励んでいた。
ある日、修行の一環として、商店街の不良退治に向かった飛鳥は、修学旅行で浅草に来たが迷ってしまったという少女と出逢う。
修行中にもかかわらず道案内を買って出る飛鳥だったが、その少女は後ろ手に短刀を隠し持っていた。
Asuka, Ikaruga, Katsuragi, Yagyu y Hibari son cinco niñas de la escuela que en secreto entrenan en las artes ninja. Ya que son enviados por su mentor, Kiriya, para manejar algunos delincuentes en la ciudad, Asuka conoce a una chica llamada Homura y ayuda a guiar a ella a través de la ciudad, sin saber que ella está secretamente un ninja enemigo.