Den tidligere ungdomspræst Roald Bergmann bliver opfordret til at tale ud med sin tidligere leder og ven i Pinsekirken, men noget holder ham tilbage. I jagten på et nyt hjem på Bornholm kommer han forbi det mørkeste sted i hans barndom, hvor gamle hemmeligheder kommer frem i lyset. En konfrontation med hans mor sender ham videre ind i den kirke, han blev smidt ud af 15 år tidligere. Sektlederens hemmeligheder er en historie om ensomhed og fælleskabets store styrke og om religionens fantastiske kræfter. Over tre afsnit følger Roald Bergmann fodsporet gennem sin families hemmeligheder og opdager hvordan, de er tæt forbundne til hans egen ungdom. Hvad er sandheden om den tro, der har givet så meget håb og kostet så meget ulykke?