Nirai-Kanai wird vor dem Eintreffen eines Dolem evakuiert. Eine Person bleibt zurück, um die Abwehrsysteme zu aktivieren. (Text: Animax)
The aerial cities continue to multiply. Kunugi decides to evacuate everyone from the island and stay by himself to try to stop the D1 headed their way. TERRA leaves with everyone else. The D1 is the Dolem of Kuki, Kunugi's former superior officer that gave him the order to kill his own daughter. It reaches the island of Narai Kanai and starts destroying cities. Kunugi sends some missiles and remote control fighter jets, but they do no good. The D1 attacks the building he's in while Kuki taunts him. Kunugi is injured, and Kuki says it's over. But Kunugi tells him that the entertainment has yet to begin, and activates the barrier creating thing. The barrier destroys everything in it's path, including the cities, Kunugi, Kuki, and the D1. Ayato makes a choice to join with Ixtli in order to protect Haruka.
Le monde entier assiste à la prolifération des cités volantes muliennes, sources d'émeutes. Au QG de TERRA, Jin Kunugi reprend ses fonctions de commandant après le limogeage de Makoto Isshiki, auteur du fiasco. Mais à peine est-il revenu qu'un hologramme apparait devant lui et le reste du personnel, celui de Masayoshi Kuki, l'ancien supérieur de Kunugi, responsable de la mort de sa fille... Celui-ci, puisque les mondes normal et celui de Tôkyô-Jupiter se chevauchent désormais, lance un ultimatum : lui remettre Xephon ou être pulvérisé par son Dolem, Largo. Mais le titan ailé est toujours enfermé dans son œuf... De son côté, Ayato brûle sa toile.
TOKYO JUPITERは消滅した。だがその結果、世界各地にMUの空中都市が出現・増殖し、ラーゼフォンは次元卵に回帰してしまう。ニライカナイの全島民を艦隊に移乗させ、撤退を開始するTERRA。リーリャ・リトヴァクの避難民の中にいた綾人は船上で玲香と再会し、気付くと2人は時の祠の前に佇んでいた。
Las ciudades aéreas continúan multiplicándose. Kunugi decide evacuar a todos de la isla y quedarse solo para intentar detener al D1 que se dirige hacia ellos. TERRA se va con todos los demás. El D1 es el Dolem de Kuki, el ex oficial superior de Kunugi que le dio la orden de matar a su propia hija. Llega a la isla de Narai Kanai y comienza a destruir ciudades. Kunugi envía algunos misiles y aviones de combate a control remoto, pero no sirven de nada. El D1 ataca el edificio en el que se encuentra mientras Kuki se burla de él. Kunugi está lesionado y Kuki dice que se acabó. Pero Kunugi le dice que el entretenimiento aún no ha comenzado y activa la creación de barreras. La barrera destruye todo a su paso, incluidas las ciudades, Kunugi, Kuki y la D1. Ayato toma la decisión de unirse a Ixtli para proteger a Haruka.
