Im Staffelauftakt sind Callen und Sam in einem U-Boot gefangen, das Terroristen präpariert haben, um einen Luftzeugträger in San Diego zu eliminieren. Hetty widersetzt sich den Vorschriften und verzichtet auf ihren Ausflug nach Washington, um bei der Suche nach ihren Agenten zu helfen und die Terrorattacke abzuwenden.
Callen and Sam are trapped in an armed submarine that terrorists have aimed to hit an aircraft carrier in San Diego. Meanwhile, Hetty defies orders and forgoes her trip to Washington, as the team tries to locate and save Callen and Sam and prevent the terrorist attack.
Sam et Callen sont retenus dans un sous-marin qui peut exploser d'une minute à l'autre. L'équipe du NCIS ainsi qu'un agent de la DEA tentent de les sortir de cette situation peu avantageuse.
Callen e Sam estão presos num submarino armado em que terroristas têm como objetivo atingir um porta-aviões em San Diego. Hetty desafia ordens e renuncia à sua viagem a Washington, enquanto a equipa tenta localizar e salvar Callen e Sam e prevenir o ataque terrorista.
Callen en Sam zitten gevangen in een bewapende onderzeeër waarmee terroristen een vliegdekschip in San Diego willen aanvallen.
Callen y Sam se encuentran atrapados en el interior del submarino que los terroristas tienen la intención de utilizar para hundir un portaaviones en San Diego. Hetty va en contra de las órdenes y renuncia a su viaje a Washington, intentando localizar a Callen y Sam mientras su equipo trata de detener el ataque terrorista.
Agenti Callen a Hanna zůstávají uvězněni v ponorce řízené skupinou islámských teroristů, kteří zároveň provozují ilegální obchod s drogami. Ostatní členové týmu se je pod vedením ředitele Grangera snaží najít. Do záchranné akce se rozhodne zapojit i Langeová, která kvůli tomu i bojkotuje svou povinnou účast na konferenci ve Washingtonu. Beale zjistí, že ponorka je vedená trojicí teroristů, kteří chtějí zaútočit na leteckou základnu v San Diegu. Deeks vyslýchá popáleného muže, který s teroristy spolupracoval, ale ten slíbí poskytnout informace jen po zaručení dodání lahve whisky na utlumení bolesti... Mezi Kensy a Talií se mezitím rozhoří spor o Deeksovu přízeň, protože se Kensy začne domnívat, že Talia začíná mít o Deekse zájem...