高校2年の岩田広一（中村蒼）は、幼馴染で同級生の香川みどり（桜井美南）と不思議な流れ星を見る。 その夜、広一は隣に住む一人暮らしの江原正三（ミッキー・カーチス）から「部屋に見知らぬ誰かが何人もいる」など奇妙なことを言われ戸惑う。翌日体育倉庫で着替えをしたみどりは、盗撮していた大森健次郎（宮里駿）を発見し揉めていると、突然幽霊らしき物体が！担任の大谷先生（京野ことみ）は生徒たちと現場検証を始める。
ある朝、家を出た岩田広一（中村蒼）は隣の家から出てくる青年と出会う。青年は江原正三（ミッキー・カーチス）の孫の山沢典夫（本郷奏多）と名乗り、隣に引っ越してきたという。二人はエレベーターに乗り合わせるが、奇妙な行動を見せる典夫を広一は不審がる。するとそこに光る何かが現れ…！？ その後、野球の試合をしていた広一の前に再び典夫が出現。野球の意味すら知らない典夫がピンチヒッターをすることになるが…。
岩田広一(中村蒼）と香川みどり(桜井美南)のクラスに山沢典夫(本郷奏多)が転校生として紹介され、昨日典夫に高校の存在を教えたばかりだった広一は驚く。 早速物理の授業で専門的な発言をする典夫だったが、次第に話はなぞめき出し…。その後、授業が始まっても教室に現れない典夫はなぜか理事長室に。親しげに寺岡理事長(斉木しげる)と会話する典夫だったが、理事長から衝撃的な事実を聞かされ絶句してしまう。
ある朝、不思議な夢で目覚めた岩田広一（中村蒼）は、母・君子（濱田マリ）の言葉から今日が妹のあすか（立川杏湖）の命日であることを思い出す。その頃山沢典夫（本郷奏多）は、モノリスでなぞの男（中野裕太）と話をしていた。通話後、典夫はとても悔しそうで…。 その後、学校のボスを広一たちから聞き出した典夫は、その人物・鎌仲才蔵（葉山奨之）を待ち伏せするのだが…。
岩田広一(中村 蒼)は下級生の咲和子(樋井明日香)から、山沢典夫(本郷奏多)が冴木小次郎(碓井将大)に屋上から蹴り落とされたことを聞く。 広一は様子を見に典夫の家に行くが、江原正三(ミッキー・カーチス)が典夫の不在を告げ出かけてしまう。 江原を尾行することにした広一は、江原と冴木が口論する姿を目撃してしまう。すると突然黒い闇が出現し、驚いた広一は香川みどり(桜井美南)に電話するが…。
冴木小次郎（碓井将大）を探す咲和子（樋井明日香）は、大量の買い物袋を下げた冴木を発見。咲和子は、いつもの乱暴な態度とは打って変わって優等生風な冴木の振る舞いに呆然となる。それに冴木の首筋に星のような形のアザがあることに気づき、不信に思うのだった。咲和子は山沢典夫（本郷奏多）の引越しを手伝う冴木をひたすら尾行。するととんでもない場面に出くわし…！ 一方、学校では典夫の気ままな行動が問題に。香川みどり（桜井美南）はそこで典夫を弁護しなかった岩田広一（中村蒼）に理由を尋ねるが…。
江原正三（ミッキー・カーチス）の家で王妃（りりィ）の手術が行われる中、香山みどり（桜井美南）が山沢典夫（本郷奏多）を訪ねてくる。その後、江原が助けを求めに岩田家へ。岩田広一（中村蒼）が江原の家に付き添うと、証言通り部屋には大勢の人間が…！思いがけない光景に広一はあぜん。 広一は身の危険を感じ逃げようとするが、そこに現れたアスカ（杉咲花）を見て驚く。一方、少女も広一を見てなぜか驚きの表情で…。
岩田広一（中村蒼）のクラスに山沢典夫（本郷奏多）のいとこ・アスカ（杉咲花）が転校生としてやってくる。女王様のような振る舞いのアスカに反発するクラスメートは、典夫とアスカを無視することに。 そんな中、典夫は王妃のＤＮＡを修復できるデータを取りに行くため、広一にアスカのことを頼む。アスカは広一の家に泊まることになるが、家で見せるアスカの明るい様子に広一は戸惑う。
王妃（りりィ）の意識が戻りアスカ（杉咲花）は安堵する。早速、建国のセレモニーが行われるが、山沢典夫（本郷奏多）は冴木小次郎（碓井将大）と交信が取れないことが気になっていた。 その頃冴木は、暗殺者のハーデス（翁華栄）にコントロールされていて…！ 翌朝、典夫からアスカの付き添いを頼まれた岩田広一（中村蒼）は、アスカの女王様のような振る舞いに右往左往。その様子に香川みどり（桜井美南）は面白くなく…。
王妃（りりィ）のわがままな言動に耐えきれなくなったアゼガミ（中野裕太）は、王妃を襲い暴言を浴びせる。山沢典夫（本郷奏多）が仲裁に入るが、アゼガミはスズシロ（佐藤乃莉）を伴い家を出ていってしまう。 一方、アスカ（杉咲花）は香川みどり（桜井美南）に「岩田広一（中村蒼）を夫にしてもいいか」と確認。その後アスカは広一を王妃に紹介するため、みどりも誘いみんなで出掛けようと提案。 そして当日…！
広一(中村蒼)たちと公園に行った時、暗殺者のハーデス（翁華栄）に王妃（りりィ）が突然刺された。典夫(本郷奏多)はハーデスを追うが…。 江原正三（ミッキー・カーチス）の家に運ぶも王妃は治療を拒否。やがて、王妃とアスカ（杉咲花）、典夫は、広一とみどりに自分たちが何者なのかを語り始める。
王妃（りりィ）が亡くなりアスカ（杉咲花）の命もわずかだと判明。そんな中、公園で映画の撮影をする岩田広一（中村蒼）はじめＳＦ研究室員たちは、アスカと山沢典夫（本郷奏多）、香川みどり（桜井美南）を呼び出し映画に出演してもらうことに。その脚本はまるでアスカたちのことのようで…。やがて夕焼けで美しく空が染まる中、撮影がスタートする。 その翌朝、アスカと典夫は突然転校してしまう。
