As the crew congratulate Shinn on his job well done, Kira takes the Freedom out into battle once more to take out the assassins that are after Lacus.
Shinn est félicité pour ses exploits face à la flotte terrienne. Sur Orb, alors que Yuna met la pression à Cagalli concernant leur possible mariage, Kira et ses camarades sont attaqués par un commando armé qui vise étrangement Lacus.
シンの活躍によってミネルバは絶体絶命の危機を脱し、カーペンタリアへ進路を取った。
一方、物思いに沈むカガリの前に現れたユウナは、彼女へ結婚を迫っていた。この不安定な情勢下であればこそ、二人の結婚は国を結集するのに役立つだろうし、コーディネイターであるアスランやキラは、今や国の母となる彼女とは住む世界が違うのだ……。ユウナの言葉に、カガリは思い悩む。
その頃、キラたちも決断のときを迎えようとしていた。オーブと大西洋連邦との同盟が締結されれば、コーディネイターであるキラたちはオーブに留まれなくなるのだ。
その夜キラの家を、コーディネイターの特殊部隊が強襲した。彼らの目的は、ラクスを暗殺すること――キラらは地下のシェルターへと避難するが、特殊戦使用ＭＳアッシュの火力が、ついにシェルターの外壁を破壊する。
なだれ込む、アッシュの部隊……そのとき、突如現れた白い機体が、アッシュの部隊を瞬く間に一掃した――。
ようやく昇り始めた日の光を浴びながら、封印から解き放たれたフリーダムガンダムが姿を現す。搭乗するキラの瞳には、強い決意の光が宿っていた。
在损失了包括2艘航空母舰在内的6艘战舰之后，地球联合军舰队的残余部队被迫撤退，密涅瓦号成功突围。归舰的真因其不可思议的战绩而得到了威诺等人的欢呼，而同为MS机师的雷也对真的出色表现加以肯定；塔丽亚和阿瑟也逐渐明白了杜朗达尔议长将脉动高达交由真驾驶的用意。另一方面，尤拉加紧了对卡嘉莉的控制。他表示将在与大西洋联邦签署协议的同时举办婚礼；卡嘉莉虽然并不甘心，但在尤拉以方方面面的“大义”劝说之下，并无他法可想。
Благодаря действиям Шина Минерва избежала смертельной опасности и взяла курс на Карпентарию.Тем временем перед погружённой в раздумья Кагари появилась Юуна и настойчиво добивалась от неё брака. В этой нестабильной обстановке их брак мог бы послужить средством объединения страны, а координаторы, такие как Асран и Кира, уже живут в ином мире по сравнению с той, кто станет матерью нации… Слова Юуны приводят Кагари в смятение.В это же время Кира и его соратники стояли перед важным выбором. Если будет заключён союз между Орбом и Атлантической Федерацией, координаторам вроде Киры нельзя будет оставаться на Орбе.Той ночью дом Киры подвергся налёту спецподразделения координаторов. Их целью была ликвидация Лакус — Кира и остальные эвакуировались в подземный бункер, но огневая мощь специального боевого МС Аш в конце концов пробила внешнюю стену убежища.Отряд Аш врывается... и вдруг появился белый мобильный костюм, который в мгновение ока…
