伊吹(綾野剛)と志摩(星野源)が追っていたエトリが、ドローンに仕掛けられた爆弾で死んだ。司法解剖の結果、エトリの正体は5年前に起きた殺人事件の容疑者であることが判明。誰が何の目的で彼を殺したのか?1機捜の糸巻(金井勇太)の調べで、エトリはいつも、システム開発に詳しい若い男の指示を受け、行動していたことがわかる。志摩はその若い男こそ、久住(菅田将暉)という男ではないかと考える。久住と面識があるのは留置場にいる高校生の成川(鈴鹿央士)だ。桔梗(麻生久美子)は、成川から久住について聞き出すよう九重(岡田健史)と陣馬(橋本じゅん)に指示。そして、伊吹と志摩にはその裏付け捜査をするよう指示し、4機捜が一丸となって爆弾犯の行方を追うが…。一方、ナウチューバー・REC(渡邊圭祐)は、逮捕された成川に代わり「浜田」と名乗る情報源から、ドローン爆発事件に関する極秘ファイルを受け取る。
Before Ibuki and Shima are able to track Etori down and arrest him, he is killed by a drone deployed with an explosive device. A post-mortem reveals that Etori was in fact none other than the chief suspect in an unsolved five-year-old murder case. But why did someone want him dead? They later learn that Etori was acting on directives from a mysterious individual, whom Shima identifies as a young IT specialist by the name of Kusumi. It will take the resources of the entire MIU 404 team to crack this perplexing and dangerous case!
동시다발 폭파 테러 뉴스 영상이 페이크라는 것을 알게 되고, 대혼란은 머지않아 수습된다. 이부키와 시마는 멜론빵 차량이 범인이 타고 있다고 인터넷에서 확산되어 더 이상 차량을 사용한 밀행을 할 수 없게 된다. 다른 차량으로 밀행을 하던 중 이부키는 시마의 태도가 이상하다고 추궁하고, 결과적으로 두 사람의 관계는 어색해지고 만다.
시마는 트럭 뺑소니를 당한 진바는 폭파 테러의 대혼란으로 응급 호송이 늦어져 버린 것에 대해 페이크인 걸 눈치채지 못하고 판단을 잘못한 자신을 책망하고... 기수 멤버들은 모두 각자 무력감에 괴로워하고 있었다.
Etori estava seguindo ordens de um mandante misterioso. Desconfiando de Kuzumi, Shima e sua unidade decidem ir atrás dele.