Der neue Lehrer an der DenTech Academy Mr. Higsby führt böses im Schilde: Er will sich die Battlechips der Schüler aneignen. Kurzer Hand manipuliert er das Computersystem, sperrt alle Kinder und NetNavis aus und fordert Yai zu einem Zweikampf heraus. Dieser weigert sich, die Life Aura- und Hero Sword Chips herauszugeben. Lan und MegaMan eilen zu Hilfe, hacken sich in das Computersystem ein und starten eine nervenaufreibende Befreihungsaktion.
An eccentric guest lecturer, Mr. Higsby, has come to Lan's school. But the lesson he wants to teach isn't on the cirriculum! The nutty professor is on a quest to ""acquire"" all rare BattleChips from those he deems unworthy. His target... Yai. Using his NetNavi, NumberMan, Higsby takes over the school's control system and locks Yai, Ms. Mari, Dex, and Maylu in their classroom, then stages a lopsided NetBattle to obtain his precious prizes. Locked outside, Lan must find a way to send MegaMan to the rescue... before it's too late!
熱斗の通う学校に特別講師としてやってきた日暮闇太郎。ところが、レアチップマニアの日暮は、やいとの持つレアチップを目当てに、やいとたちを教室に閉じ込めて自分のナビ、ナンバーマンとバトルさせ、チップを奪おうとする。教室外にいる熱斗は、教室にかけられたロックを解き、無事やいとたちを助け出せるのか・・・。
Il signor Higsby è un collezionista di Battle Chips molto rari che usa in battaglia per potenziare il suo Net-Navi chiamato NumberMan per rubare altri chips. Quando è invitato nella scuola di Lan per tenere una lezione, intrappola Yai e gli altri in una delle classi, compromettendo il sistema di sicurezza dell'edificio e minacciando di eliminare Glide se Yai non gli consegnarà i suoi Battle Chips rari. Lan, che è fuori dalla stanza, lavora contemporaneamente a MegaMan per scoprire le password necessarie a sbloccare il codice di sicurezza della scuola e salvare i loro amici.
Un conférencier invité excentrique, M. Higsby, est venu à l'école de Lan. Mais la leçon qu’il veut enseigner n’est pas inscrite au curriculum ! Le professeur fou est en quête pour « acquérir » tous les BattleChips rares de ceux qu’il juge indignes. Sa cible... Ouais. À l'aide de son NetNavi, NumberMan, Higsby prend le contrôle du système de contrôle de l'école et enferme Yai, Mme Mari, Dex et Maylu dans leur classe, puis organise une NetBattle déséquilibrée pour obtenir ses précieux prix. Enfermé dehors, Lan doit trouver un moyen d'envoyer MegaMan à la rescousse... avant qu'il ne soit trop tard !