時は戦国時代。宣教師ヴァリニャーノは、日本での布教を進めるため、ある秘策を思いつく。日本の少年たちをヴァチカンに連れて行きローマ法王に謁見させ、聖書に記された「東方三賢人=MAGI」の言い伝えを現実化する。ヴァリニャーノは四人の少年を連れて、天下人織田信長に会いに出発する。