ロイミュードを撲滅し、ベルトさんが進ノ介のもとから去って数日。世の中には、平和な日々が戻っていた。特状課の片づけに戻った進ノ介だったが、最後にもう一つだけ気になる事件の捜査を始めていた。１年半前にグローバルフリーズが起きた日、相棒の早瀬刑事と追っていた反政府組織・ネオシェード。奴らがまた動き出したのだ。実は1ヶ月ほど前にもネオシェードとロイミュードのつながりを突き止めていた進ノ介。ところがロイミュードが滅んだ今になっても、ネオシェードが動く理由とはいったい何なのだろうか？ その謎の鍵は、奴らが盗み出した不思議な物体が握っていた。それは眼魂（アイコン）と呼ばれるものだった―――。
One year ago, Shinnosuke and Hayase were investigating the anti-government organization called Neo Shade. Now they’ve become active again, a Neo Shade thief breaks into the Metro Police Department to steal an item that had been left behind at a crime scene. The mysterious item, called a Ghost Eyecon, that had been left behind at the crime scene seems to be connected to the case.
