国民的人気タレント『ねむ』が犯罪組織に攫われた！ 誰もが絶望しかけたその時、現れたのは最強のエージェント！ 「コードナンバー：セブン、ミッションを遂行する」 颯爽と戦うセブン！ねむを助け出し、２人はいい雰囲気に― ……という夢を見ていた、普通の好青年・万津莫。 誰かを助けようとすると、なぜか自分だけ悪夢のような不幸に見舞われてしまう不運体質の彼が理想の自分になれる唯一の場所。 それが夢の世界なのである。 しかし、そんな夢の世界へ悪夢の怪人・ナイトメアが襲い来る！ 夢を侵略し、現実までも侵食しようとする奴らを止めるため、莫は立ち上がった。 現実では普通でも、夢なら最強！！ 莫が夢を信じるとき、『仮面ライダーゼッツ』は目覚める。
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夢の中でなぜか逃亡犯となっていた莫（今井竜太郎）。爆弾魔のナイトメアに遭遇するとゼッツに変身するが逃げられてしまう。ある夜、突如ゼロ（声・川平慈英）に呼び出された莫は「他人の夢に潜入しナイトメアの悪夢を未然に防げ」という指令を受ける。ということは、あの爆弾魔を止めなければ…。莫の“夢主”を守るためのミッションがスタートする！
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夢主は富士見刑事。 だが、富士見は本当に連続爆破事件を望んでいたのか？ 深層心理の底に眠る心の扉。 その最後の１つが開かれれば、悪夢は現実へと溢れ出してしまう！ 夢なら最強！！ ……でも現実は普通の好青年だった莫。 ゼッツとして。 エージェントとして。 本当の戦いがいま始まる。
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夢の仮面ライダー、目覚める。 夢に潜入して人々を救うミッションスタート!
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なぜ花嫁の美雪が夢見る者なのか？現実世界で情報収集を続けるバクは、公園の大木の前に立つ美雪と接触する。美雪には、人生を変えるほどの記憶があることを知る。 夢の世界で、バクは美雪の「心の扉」を見つけ、その扉の向こうに広がる思いがけない光景を目にする。そして、再び現れたカラスの悪夢が、美雪たちを襲う！
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今宵のミッションは巨大監獄からの脱出。 そして捕らわれたターゲットは……ねむちゃんのご両親！？ 世界観、登場人物、ナイトメア。 全てが謎に包まれた夢の中で、莫は夢主の深層心理にたどり着くことができるのか？ 切り札は「ゼッツカメラ」と「マシーナリー」カプセム。 そして遂に、夢を彷徨う謎の男『ノクス』が動き出す！
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脱出不可能な巨大監獄は、プリズンナイトメアそのものだった！ ナイトメアは夢主の深層心理の現れ。 そこには、美女木社長が『ねむ』を監獄に閉じ込める真の理由があった。 それは国民的人気タレントに隠された、とある秘密―― 現実の苦しみから逃れるために作り出された悪夢を壊すことは、夢主を救うことなのだろうか。 「プロジェクション」カプセムは、全ての真実を映し出す。
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創業100年の老舗レストラン『ロワイヤル城金』。 伝統の味を守り続け、国際会議でも料理が提供されるほどの有名店だ。 しかし今、この店は生物兵器の脅威に晒されている。 次々と倒れるシェフたち。 犯人は誰なのか、そして姿の見えない敵への対抗手段とは？ ここは「リカバリー」カプセムの出番だ、セブン。
