L'isola vulcanica viene assegnata alla diabolica Marchesa Yanus. L'isola vulcano si inabissa e il movimento tellurico viene subito rilevato dalla fortezza delle scienze. Mazinga parte in avascoperta ma viene abbattuto e intrappolato in fondo all'oceano in una bolla di gomma. Un mostro guerriero attacca la fortezza, difesa da Boss e Jun ma la marchese Janus, il nuovo comandante della Base Vulcanica, rapisce Shiro e l'amichetta Aruna. La marchesa vuole il professore in cambio dei ragazzini ma Mazinga riesce a liberarsi della trappola sconfiggendo il mostro e salvando i compagni dalla minaccia del nuovo comandante.
「あたしが他の将軍とはちょいと違うところを見せてやらなくてはな」（ヤヌス） 火山島要塞・新司令官の任についたのは、アルゴス長官直属の部下・ヤヌス侯爵。彼女はグレートマジンガーを海底に設置したリング・バリアに捕獲し、戦闘獣バーグルに研究所への攻撃を開始させ、そして自らも現場に赴いてシローとハルナを捕えた。人質をとられ、剣造所長は研究所放棄の要求に従わざるを得なくなってしまう。
