Boss robot si reca sull'isola vulcanica recentemente venuta alla luce per investigare sull'accaduto. Nel frattempo sull'isola i soldati di Mikenes stanno costruendo la nuova base per attaccare la Fortezza delle scienze. Boss, durante la sua perlustrazione, precipita su un mostro guerriero che si sta dirigendo verso la base di Mazinga. Tetsuya esce col suo robot per controllare la situazione e si scontra subito col mostro salvando Boss dal pericolo. Un secondo mostro attacca la città e viene affrontato da Venus Alfa con l'aiuto di Boss. I due vengono presto messi fuori combattimento mentre il Grande Mazinga sconfigge il mostro che minacciava la fortezza e affronta anche il secondo mostro. La lotta è dura e stavolta l'aiuto di Boss è determinante che riesce a sconfiggerlo, dando la possibilità a Mazinga di eliminare il mostro. Il Duca Gorgon però viene ferito mortalmente nello scontro con Mazinga; tornato alla base, morirà solo dopo essere stato nominato comandante della fortezza avanzata recentemente completata e aver realizzato il suo sogno.
「いよいよこれから新しい戦いへの出発をするのだ!」(ゴーゴン) ボスボロットの自力飛行テストが行われていた。だが、動力が人力のため、ムチャとヌケの体力が限界に達したと同時に海上へ落下してしまい、研究所はグレートマジンガーを救助に派遣する。ところがその間に戦闘獣ダンダロスが研究所を襲撃!一方、ボスボロット探索中のグレートマジンガーは、戦闘獣ガバラと交戦状態に入っていた。