次々と出現するマギュアは明らかに繁殖能力を持つマザーマギュアの存在を決定づけるものとなっていた。つばさとヒカルは、対マギュア用の新兵器の開発データを取るため、バーチャル・シミュレーションを繰り返すが、つばさは慣れない訓練と戦いの不安からすっかり元気をなくしてしまう。そんな彼女を心配したヒカルは…。