「宝島」の本を読んだのび太が、自分も宝探しをしたいと言いだした。一同は、ドラえもんの「宝探し地図」を手に、海の冒険へ出かける。
みんなが冒険を満喫していたそのとき、突然異変が起き、船は本当の海賊がいた17世紀のカリブ海へタイムワープしてしまった！
海賊船に襲われる中、のび太は海に流されてしまい、ドラえもんは大事なポケットをなくしてしまうという大ピンチに…！
The search for documentation about the sea for a school work will make the magic door of Doraemon open and take Nobita to Shizuka, Gian and Sueno in the deep ocean. This time our friends embark on a huge and unique boat in order to learn about the mysteries of the sea and look for treasures. What nobody imagines is that a distortion in the line of space-time will lead them to the seventeenth century amid a great storm that will make them wreck and where Doraemon loses its magic pocket. No time to lose, our friends must find a way out. Will they succeed?
