Während Lucrezia die Geschäfte im Vatikan leitet, zieht Rodrigo sich mehr und mehr aus der Öffentlichkeit zurück. Er versucht nun ein gottesfürchtiges Leben zu führen und seine Gefühle für seine ehemalige Geliebte Giulia und seine eigene Tochter zu unterdrücken. Aber selbst abgeschottet von allen Versuchungen fällt es Rodrigo schwer, sein Verlangen zu zügeln.
Lucrezia ist mittlerweile mit Alfonso von Aragon verheiratet, dem Herzog von Bisceglie und illegitimen Sohn von König Alfonso ll. von Neapel. Jedoch läuft die Ehe alles andere als harmonisch. Von seiner Frau und Cesare gedemütigt, wird Alfonso zum Spitzel von Rodrigos Feinden im Vatikan.
Auf dem Stuhl Petri erweist Lucrezia sich als überaus fähige, gemäßigte und weise Regentin – Eigenschaften die ihrem Bruder Cesare offensichtlich fehlen.
Dieser versucht derweil abtrünnige Provinzen des Kirchenstaates wieder unter päpstliche Kontrolle zurückzubringen, geleitet wie eh und je von seinem Drang nach militärischen Großtaten. Gleichzeitig erhält er von seinem Vater den Auftrag Giulia Farnese auszuspionieren.
Als Rodrigo schließlich nach Rom zurückkehrt, macht er Lucrezia zu seiner Beraterin.
While Lucrezia is head of the Vatican, Rodrigo Borgia continued his retreat. He tries to erase his feelings of love for Julia and her desire for her own daughter, now married to Alfonso di Calabria. But even away from all temptations, he struggles to get there. For his part, his daughter, a young woman who became regent seat with wisdom and moderation, qualities that are lacking in Cesare. The latter, still at war in Romagna, hopes to achieve with a little luck to defeat Catarina and all the enemies of the Borgia family ...
Pendant que Lucrezia est à la tête du Vatican, Rodrigo Borgia continue sa retraite spirituelle. Il tente d'effacer ses sentiments amoureux pour Giulia et son désir pour sa propre fille, mariée désormais à Alfonso di Calabria. Mais même éloigné de toutes les tentations, il peine à y arriver. De son côté, sa fille, une jeune femme devenue régente, siège avec sagesse et tempérance, des qualités qui font défaut à Cesare. Celui-ci, toujours en guerre en Romagne, espère parvenir, avec un peu de chance, à défaire Catarina et tous les ennemis de la famille Borgia...
Mentre Lucrezia è a capo del Vaticano, Rodrigo Borgia continua il suo ritiro. Tenta di superare i suoi sentimenti romantici per Giulia e il suo desiderio per la propria figlia, ora sposata con Alfonso di Calabria. Ma anche lontano da tutte le tentazioni, lotta per arrivarci. Da parte sua, la figlia, divenuta reggente, governa con saggezza e temperanza, qualità che mancano a Cesare. Quest'ultimo, ancora in guerra in Romagna, spera di ottenere con un po' di fortuna, di annientare Caterina e tutti i nemici della famiglia Borgia.
Eftersom Rodrigo Borgia har dragit sig tillbaka till ett kloster sköter Lucrezia officiella uppdrag som kyrkans regent med stor färdighet och mycket värme. När han återvänder gör han henne till sin första rådgivare.