Um den Papst vor einer Verschwörung zu warnen, kehrt Cesare nach Rom zurück. Er will Rodrigo warnen, doch dieser zeigt sich wenig dankbar. Unterdessen nähert sich die neapolitanische Flotte Rom, dessen Häfen von Kardinal della Rovere, einer Marionette Frankreichs, abgeriegelt sind. Um sowohl gegenüber ausländischen Feinden als auch den mächtigen italienischen Königreichen bestehen zu können, schmiedet Rodrigo als Oberhaupt des Kirchenstaats eine Allianz mit den italienischen Stadtstaaten. Zur Sicherung des Friedens zwischen Neapel und Rom wird Rodrigos jüngster Sohn, der elfjährige Goffredo, mit Kronprinzessin Sancia verlobt. Der Frieden in der Ewigen Stadt bleibt brüchig, und so macht Rodrigo den Orsini gegenüber Zugeständnisse. Aber nicht nur die Männer schmieden Allianzen: Vannozza und Giulia sind vereint im Hass auf Adriana de Mila. Vannozza sorgt sich um Lucrezia, und Giulia möchte sich sowohl von ihrer Schwiegermutter als auch von ihrem eifersüchtigen Ehemann befreien. Als Giulia, die ein Kind von Rodrigo erwartet, von Unbekannten angegriffen und verletzt wird, sucht Rodrigo rasend vor Wut nach dem Schuldigen. Zugleich besinnt er sich auf Menschen, die ihm nahe stehen, und ernennt Cesare und Alessandro zum Kardinal. Während der Zeremonie bekennt Rodrigo öffentlich die Vaterschaft seiner Kinder. Lucrezia will die Feierlichkeiten nutzen, um endlich ihren Ehemann heimlich lieben zu dürfen, doch die beiden werden überrascht.
As peace remains brittle, Rodrigo publicly acknowledges his paternity of Juan, Cesare, Lucrezia and Goffredo to strengthen the family bonds.
Un ambassadeur espagnol informe le Vatican que Christophe Colomb vient de découvrir un nouveau territoire. L'Espagne et le Portugal se disputent le droit de coloniser ces espaces, et c'est à Alexandre VI d'arbitrer ce litige. Contre l'avis de son père, Cesare revient à Rome pour l'informer qu'un complot se trame. Rodrigo lui demande de rester chez sa mère en attendant davantage d'instructions. Lucrezia attend avec impatience une occasion pour consommer son mariage. Sa mère, Vanozza, rencontre en secret Rodrigo et lui demande de reconnaître ses quatre enfants et de faire spécialement attention à Cesare...
האפיפיור מתבקש להכריע בתביעת הריבונות של ספרד ופורטוגל על העולם החדש שקולומבוס גילה. מלך ספרד מציע לו בתמורה את נישואי חואן לאחייניתו. צזרה מגיע לוותיקן לדווח על הקשר נגד האפיפיור, אך נשלח מיד לבית אמו.
La Francia dichiara guerra al Regno di Napoli gettando nello sconforto Rodrigo, alla vana ricerca di alleati. Lucrezia, innamorata di Alfonso d’Este, dopo aver chiesto inutilmente il divorzio, decide di avvelenare il marito. E mentre i Borgia si rifugiano a Castel Sant’Angelo per resistere all’assalto francese, Cesare, ostaggio dei Colonna, subisce la perversa vendetta di Marcoantonio.
Krzysztof Kolumb właśnie odkrył Amerykę. Aleksander VI musi rozstrzygnąć spór między Hiszpanią a Portugalią. W tym czasie Della Rovere przekonuje króla Francji, Karola VIII, by najechał Włochy i usunął papieża. Alessandro Farnese i Cezar są mianowani na kardynałów. Wkrótce Aleksander VI, pod naciskiem Vanozzy, uznaje trojkę swoich dzieci.
Испанский посол в Ватикане сообщили, что Колумб только что открыл новую территорию. Испания и Португалия борются за право колонизации этих районов, и это был Александр VI об арбитраже этом споре. Несмотря на советы своего отца Чезаре вернулся в Рим, чтобы сообщить ему, что заговор зреет. Родриго говорит, чтобы он остался с матерью до получения дальнейших инструкций. Лукреция выразил надежду на возможность, чтобы довести до его брака. Его мать, Vanozza, Родриго встречались тайно и просит ее четырех детей распознавать и обратить особое внимание на Чезаре ...
Como la paz sigue siendo frágil, Rodrigo reconoce públicamente su paternidad de Juan, César, Lucrecia y Goffredo para fortalecer los lazos familiares.
Spanska ambassadören De Haro förkunnar att Christofero Colombo har upptäckt den nya världen. Om Rodrigo beslutar att Spaniens anspråk är rättmätigt ska kung Ferdinand gifta bort prinsessan Maria Enriques de Luna med Juan.