Shadow alias B-9 kann sich plötzlich wieder an seine Vergangenheit erinnern. Er war Teil grausamer Experimente, die ein gewisser Dr. Guillia zu verantworten hatte. An ihm will sich Shadow nun rächen.
ミレニアム・シティプロジェクトによって、東京シティは日本列島と切り離され、宙に浮き始めていた。その頃、さゆりの案内で財前邸に来ていたシャドウはついにギルリアと出会う。激しい戦闘の最中、ついにシャドウの記憶が蘇る。そしてBプロジェクトの全貌とギルリアとの関係が明かされる。
Due to the Millennium City Project, Tokyo City was separated from the Japanese archipelago and began to float in the air. Meanwhile, Shadow, who was visiting the Zaizen residence with Sayuri's guidance, finally meets Gilria. In the midst of a fierce battle, Shadow's memories finally return. And the full picture of the B Project and his relationship with Gilria are revealed.
