Wir befinden uns im 21.Jahrhundert, wo die zunehmende Technisierung viele Barrieren überwunden hat und auch die Verbrechen mit Hilfe modernster Techniken immer skrupelloser werden.
Ein Verbrechersyndikat hat es sich zur Aufgabe gemacht, die Herrschaft über die Menschheit an sich reißen und dabei ist ihnen jedes Mittel recht. Ganze Armeen von Robotern und Cyborgs tyrannisieren die Menschen und Städte. Um diesem Treiben ein Ende zu bereiten, ruft die Regierung ein Geheimprojekt ins Leben: Die Spezialeinheit Metal Jack, die aus Geheimpolizisten mit außergewöhnlichen Fähigkeiten besteht.
Prince Jorudi with his brother Hai Sharutatto are fighting against their father, Madaru, with his evil world domination ambition using giant robots. However, both Prince Jorudi and his brother's goal might not be the same even though they are both fighting their father, a tryrant. While Prince Jorudi goals is to save the world from his father ambition, Hai Sharutatto plans to take over his father's place and therefore he sees Jorudi and their sister, Chururu as nothing but rivals. Legend tells of a mysterious avenger, known as the Iron Giant will overthrow the tyrant.
때는 미래. 세계유수의 하이테크도시 'TOKYO 시티'에는 살인, 테러, 전뇌범죄등 경찰이 대응할 수 있는 한계를 넘은 범죄들이 일어나고 있었다. 경시청의 다이고 마사나오는 이전부터 구상해왔던 '메탈 프로젝트'에 상응하는 인재를 찾기 시작한다. 그러던 어느날, 세계적인 재벌인 '자이젠 콘체른'이 주최한 파티에 범죄조직 '이드'가 파견한 괴로봇 크라임 모빌 군단이 나타나 자이젠 콘체른의 중핵인 자이젠 준을 공격한다. 준을 막기위해 몸을 날려 중상을 입은 경시청 형사 칸나기 켄, F1레이서 아그리 료, 프로레슬러 고다 고의 행동에 감복한 다이고는 빈사상태인 3명의 젊은이를 사이보그로 개조, '기갑경찰 메탈잭'이라는 새로운 몸을 부여한다.
世界有数のハイテク都市「TOKYOシティ」。主人公の神崎ケンは、警視庁捜査課の若手捜査官。署内きっての射撃の名手である。ある日、ケンは世界的財閥である「財前コンツェルン」のパーティーのガードを命ぜられた。ガードする相手が大物とあって、ケンは大ハリキリである。だが、パーティー会場に突如怪ロボットが出現! 財前総帥は命を落とし、ケンと息子の純も瀕死の重傷を負う。そして、パーティーの主賓であったレーサーのアグリ・亮、覆面レスラーの豪田剛も、重症を負った。死の淵を彷徨う3人の若者……。そして、数日が過ぎた。
東京湾に浮かぶフローとタウンに謎の組織「イド」の率いるロボット軍団が現れ、警察や軍隊も、その前にはなす術がない。そこへメカニカルスーツに身を包んだ3人の若者が現れた! 彼等こそ、サイボーグ捜査官として蘇った「機甲警察メタルジャック」なのだ。
「ジャックスーツ」から「ジャックアーマー」へ、華麗なる「メタルジャック」の活躍で、ロボット軍団はことごとく粉砕され、メタルジャックは見事に勝利を飾るのであった。
かくして、未来都市「TOKYOシティ」を舞台に、ハイテク犯罪と「メタルジャック」の戦いが始まる――。