Mikotos Siegesfreude wird von Misaka 10031 ein Ende gesetzt, die ihr mitteilt, dass die Klonexperimente noch im Gange sind.
Misaka and Kamijo meet again at the malfunctioning vending machine in the park, where Shirai mistakes him for being Misaka's boyfriend. Misaka becomes shaken when she bumps into another Misaka clone, and learns that the experiments are still ongoing.
関係していた研究機関は全て稼働を停止し、『実験』を中止に追い込むという自分の目的は達せられた。孤独な戦いを終えて、ついに日常へと戻った美琴の前に、ツンツン髪の少年、上条当麻が姿を現す。なにかと絡んできてはやりあっていたはずなのに、その事実を覚えていない上条にキレる美琴。さらに自分を慕う後輩の黒子が乱入してきての大騒ぎが始まる――。以前と変わらぬ、日常の空気に安心しかけた美琴の前に現れたのは、『妹達』。自分がとどめを刺したはずの『実験』は、依然として継続されている。愕然とする美琴に、さらに驚愕の事実が立ちはだかる――。
계획을 중지시키고 평화를 찾은 미코토는 평소 자주 가던 자동 판매기 앞에서 카미조 토우마와 재회한다. 반가운 마음에 토우마와 시간을 보내던 미코토의 앞에 낯익은 목소리가 들려오고, 그녀의 앞에 시스터즈가 나타나 계획의 계속되고 있음을 얘기해 주는데…
Mikoto se encuentra con Tōma, quien parece tener problemas para recordar quién es ella, y destroza una máquina expendedora para escupir bebidas para compensar algo de dinero que le había robado. Kuroko llega a la escena y, a pesar de no estar contenta con la presencia de un supuesto 'novio', se siente aliviada de que Mikoto parezca haber vuelto a ser alegre.
Il trionfo di Mikoto viene interrotto dall'arrivo di Misaka 10031, un'altra delle Sisters, che le comunica che gli esperimenti sono ancora in corso.
Misaka en Kamijo ontmoeten elkaar weer bij de defecte automaat in het park, waar Shirai hem aanziet als Misaka's vriendje. Misaka wordt geschokt wanneer ze tegen een andere Misaka-kloon botst en ontdekt dat de experimenten nog gaande zijn.
Mikoto nie może cieszyć się zwycięstwem — zjawia się kolejna Siostra, Misaka 10031, i informuje ją, że eksperymenty z klonowaniem nadal trwają.