Mikoto wurde in ihrem Kampf gegen Frenda und die restliche ITEM-Söldnertruppe geschwächt und kann Shinobu daher nicht helfen, als diese gefangen genommen wird.
As Misaka continues her way into the research facility, she and Mugino play a game of cat-and-mouse. Meanwhile, at the other facility, Nunotaba sneaks into a control room, planning to disrupt the experiment by adding a new factor to the Misaka Network.
施設防衛の依頼を受けた暗部組織『アイテム』のひとり、フレンダによって張り巡らされた罠を突破し彼女を追い詰めた美琴。その目の前を、まばゆい光の帯が駆け抜ける。現れたのは『アイテム』のリーダーにして『原子崩し(メルトダウナー)』の名を持つ、第四位の『超能力者(レベル5)』麦野沈利だった。消耗していた美琴は逃亡を図るが、麦野の激しい攻撃は止む気配を見せるどころか、着実に後を追ってくる。それは麦野の背後にいるもうひとりの『アイテム』のメンバーの能力で――。一方、脳神経応用分析所に呼び出された布束は、かつて自らがかかわっていた研究の後始末をつけるべく、決意を固めていた。
미코토를 도와 시스터즈를 구하려고 했던 누노타바 시노부는 대기하고 있던 키누하타에게 잡혀 도리어 목숨을 잃을 위기에 처한다. 한편 끊임없이 미코토를 공격하던 무기노는 미코토가 학원 도시 제3위의 레벨5, 레일건이라는 사실을 눈치채고 미코토와 정면승부를 하는데…
Mikoto intenta escapar de los ataques de Shizuri, lo que resulta difícil debido a que el tercer miembro de ITEM, Rikō Takitsubo, usa su habilidad AIM Stalker para ayudar a Shizuri y Frenda a atacar su posición.
Mikoto è indebolita dalla battaglia contro Frenda e gli altri mercenari di ITEM e non riesce a correre in aiuto di Shinobu, ora prigioniera.
Terwijl Misaka haar weg vervolgt naar de onderzoeksfaciliteit, spelen zij en Mugino een kat-en-muisspel. Ondertussen sluipt Nunotaba in de andere faciliteit een controlekamer binnen, met de bedoeling het experiment te verstoren door een nieuwe factor aan het Misaka-netwerk toe te voegen.
Mikoto jest osłabiona po walce z Frendą i innymi najemnikami ITEM-u, przez co nie może przyjść z pomocą uwięzionej Shinobu.