Als Accelerator und Last Order sich über ihr Treffen freuen, werden sie von den Hound Dogs begrüßt. Eine verdächtige Person schleicht sich ins regnerische Academy City.
Accelerator attempts to make amends for his past by doing a few good deeds, but ends up attacked by a group led by someone from his past. Meanwhile, Toma discovers strange goings-ons in the police force and overhears talk of an intruder in Academy City.
紆余曲折を経て、打ち止め（ラストオーダー）と再会した一方通行（アクセラレータ）。はしゃいで転んだ彼女を手当てするべく薬局に向かった彼の前に、突然、黒づくめの集団が現れる。『猟犬部隊（ハウンドドッグ）』――学園都市の暗部に属する者たちは、予告もなく一方通行に襲いかかる。その中には白衣の男――一方通行の開発に携わった研究者、木原数多の姿があった。『ベクトル操作』を無効化して一方通行を打ち倒した彼は、なぜか打ち止めは自分が回収すると言う。そして逆上する一方通行に、打ち止めの存在する、本当の理由が明かされる……。同じ時。『警備員（アンチスキル）』たちを無力化し、雨の降りしきる学園都市へと侵入してきた者がいた――。
En Russie, Sasha Kruezhev essaie d'apprendre les effets secondaires de son corps après que l'archange Gabriel l'a possédée mais est harcelé par son supérieur Vassilisa. Alors qu'Accelerator rentre Last Order chez elle, elle trébuche et se gratte les genoux alors il va lui acheter des bandages. Cependant, il est bientôt attaqué par un groupe de soldats armés appelé les chiens de chasse dirigés par son ancien mentor, Amata Kihara. Alors qu'Accelerator traite facilement avec ses hommes, Amata, qui avait aidé Accelerator à apprendre ses pouvoirs, connaît toutes les astuces pour nier sa capacité et le bat brutalement. Lorsque les Hound Dogs tentent de kidnapper Last Order, Accelerator parvient à rassembler suffisamment de force pour la mettre en sécurité, avant qu'Index, qui voulait lui rendre un paquet de mouchoirs, n'apparaisse sur la scène.
Accelerator y Last Order regresan a la casa de Yomikawa pero son atacados por Amata Kihara, antiguo mentor de Accelerator, junto con sus soldados. Su objetivo es en capturar a Last Order. Accelerator pelea contra Kihara;sin embargo, su habilidad no funciona con el y es derrotado fácilmente. Con lo último de sus fuerzas lanza a Last Order lejos de ellos y luego Index aparece. Por otro lado una maga de los católicos llega a ciudad academia.
Mentre Accelerator e Last Order si rallegrano del loro incontro, gli Hound Dog sopraggiungono. Una figura sospetta si infiltra nella Città-Studio sommersa dalla pioggia.
Accelerator probeert zijn verleden goed te maken door een paar goede daden te doen, maar wordt aangevallen door een groep onder leiding van iemand uit zijn verleden. Ondertussen ontdekt Toma vreemde gebeurtenissen bij de politie en vangt hij een gesprek op over een indringer in Academy City.
Akcelerator i Ostatni Rozkaz cieszą się z ponownego spotkania, ale niestety wpadają na Psy Gończe. Tajemnicza postać infiltruje zalane deszczem Academy City.
