Alternate chronology starting from Gundam Seed.
地球連合軍のオーブ侵攻に巻き込まれ、戦火を逃れる最中に眼前で両親と妹を失ったシン・アスカ。悲しみにくれながら失意のうちにオーブを去った彼は、プラントへと渡る。そして、C.E.73 彼はザフトの戦士になっていた…。
警報アナウンスが響き渡り、地球は未曾有の悲劇に見舞われた― C.E.（コズミックイラ）73。 ザフトによるユニウスセブン落下の衝撃波は、都市を打ち砕き、津波が逃げ惑う人々を呑み込み、地球に深い傷跡を残していった。 恐怖と混乱のさなか、一体のモビルスーツが打上げの時を控え静かに空を見上げていた。 その純白の機体－STARGAZER－と共に星の世界を想うDSSDモビルスーツ開発チーム所属セレーネ・マクグリフ。そしてまた一人、星の見えない黒煙の空を冷たい眼差しで見上げる地球連合軍ファントムペイン所属ストライクノワールパイロットスウェン・カル・バヤン。 重ならない彼らの視線の先に、星はまだ見えない・・・。