ゾイドに憧れる少年アラシは森の中で、窮地に追い込まれた。そこへ現れ、アラシを助けたのは、ゾイドに乗って世界を旅するシュプリーム団のリーダー・ベー コンだった。彼らの目的は、ゾイドの王と呼ばれるワイルドライガー。再び森に入ったアラシは、その伝説のライオン種ワイルドライガーと遭遇する!